目的探讨支气管镜在下呼吸道感染病原学诊断中的应用价值。方法选取92例下呼吸道感染患者，分别采用纤维支气管镜肺泡灌洗和无菌吸痰管采集患者下呼吸道感染部位的分泌物标本。对比分析两种采集方法的标本合格率、病原菌阳性检出率、病原菌分布特点以及两种采集方法的一致率。结果纤维支气管镜肺泡灌洗的标本合格率为97.83%（90/92），高于无菌吸痰管吸痰的70.65%（65/92）（P＜0.05）。纤维支气管镜肺泡灌洗的阳性检出率为86.67%（78/90），高于无菌吸痰管吸痰的47.69%（31/65）（P＜0.05）。无菌吸痰管吸痰的31例阳性患者共检出56株病原菌，其中革兰阴性菌占比为58.93%；纤维支气管镜肺泡灌洗的78例阳性患者共检出101株病原菌，其中革兰阴性菌占比为66.34%。两组革兰阴性菌均以肺炎克雷伯菌、铜绿假单胞菌为主。两种采集方法的一致率为44.57%(41/92)。结论采用纤维支气管镜肺泡灌洗诊断呼吸道感染，具有标本合格率高、准确率高、误诊率低等优势，值得推广运用。