目的探讨电子支气管镜肺泡灌洗术在重症肺炎病原学诊断中的应用价值。方法选取 51例重症肺炎患者作为研究对象，随机分为观察组（n=26）和对照组（n=25）。观察组患者行电子支气管镜肺泡灌洗术，对照组予常规吸痰，对比分析两组的临床疗效、病原学检出情况、不良反应发生情况等指标差异。结果观察组病原菌检测阳性率高于对照组，差异有统计学意义（P＜0.05）。两组不良反应发生率对比，差异无统计学意义（P＞0.05）。观察组治疗总有效率为96.15%（25/26），高于对照组的76.00%（19/25），但差异无统计学意义（P＞0.05）。结论电子支气管镜肺泡灌洗术可提高重症肺炎患者病原学检测的阳性率，实现针对性制订抗菌方案，提高治疗效果，安全性好，值得推广应用。